Tuesday, November 24, 2009

How To Beat The Levelin Supertux

swine flu patients hospitalized with and without underlying disease

In Italy, mortality from influenza in an often undecipherable, never bring real data and official statistics or even externalizing unnecessary "duplication" of data, including seasonal influenza and pandemic influenza. try to go beyond the numbers up by our opinion makers and experts of "statistical media" and see what are the systems that we permetttono to assess mortality trends and possible scenarios of the "influences".
statistics of mortality and ICD classification systems Istat through the investigation of the causes of death detects all deaths in our country of the overall population. The survey is made through the use of models and ISTAT ISTAT D.4 D.5 (details of death beyond the first year of life for male and female), ISTAT and ISTAT D.5 D.4 bis bis (details of death in the first year of life for male and female).
in official statistics refers to the "root cause", ie the disease or traumatic event that, through any intermediate complications or disease states has led to the death and will follow the rules set by the International Classification of Diseases (ICD ICD-10 online
The mortality statistics are compiled from information contained in the ISTAT attributing each death to a single cause.
If the certificate is given a single morbid condition, questa sarà la causa di morte ed il processo di codifica sarà una traduzione della descrizione della condizione morbosa in codice.
Se sul certificato sono riportate più condizioni morbose, si tratta di applicare un algoritmo decisionale per individuare un’unica causa di morte ed il processo di codifica consisterà in una serie di passaggi decisionali standardizzati (algoritmo) che conducono all’attribuzione del decesso ad un’unica causa di morte. Per questa standardizzazione l'OMS raccomanda di utilizzare le tavole decisionali "ACME" pubblicate dal CDC.

ACME

I processi di revisione della classificazione previsti all'incirca con cadenze decennali, hanno determinato l'introduzione di nuove condizioni morbose, con un numero di codici quasi doppio rispetto alla precedente classificazione (ICD9), e una discontinuità formale generata dal passaggio da codici numerici a codici alfanumerici (ICD10).
A partire dal 2000, a livello internazionale le statistiche di mortalità sono ormai prodotte utilizzando la classificazione ICD10 in numerosi paesi. In Italia l'ISTAT ha utilizzato la classificazione ICD9 per la mortalità fino all'anno 2002, mentre utilizza ICD10 a partire dai decessi dall'anno 2003.
Di questa continua evoluzione bisogna tener conto per analizzare i dati di mortalità relativi all'influenza stagionale nel nostro paese.
Con i precedenti sistemi di classificazione (ICD9 and ICD8) mortality data for influenza in Italy from 1969 to 2001 were collected over the years, many studies, combining the codes for "pneumonia and influenza" (for ICD9 codes 480-487 and 470-474 for ICD8).
So let's look at the mortality tables

Istat (the most recent 2006), the "real" data for classification ICD10 concerning mortality "pneumonia and influenza (codes J10-J18).
Istat (1) gives the absolute number of deaths due to age, etc., in the form of text files that must be reworked.
From these data broken down by age (Table 1 males and females Table 2, etc.) it is confirmed that the mortality l'influenza stagionale riguarda prevalentemente la popolazione anziana (i 7047 morti rappresentano lo 0,012% della mortalità generale per l'anno 2006).
Tassi di mortalità e statistiche storiche

I dati di mortalità sotto forma di tassi sono invece pubblicati storicamente dall'ISS (rapporti Istisan) e sono disponibili per una analisi storica a partire dal 1969. I tassi di mortalità (grezzi e standardizzati) rappresentano gli indicatori epidemiologici più utili per analizzare la mortalità per cause in una popolazione, ma sono resi disponibili attualmente fino al 2002 sulla banca dati dell'ISS mentre gli ultimi dati Istat (stime preliminari aggregate per grandi gruppi) arrivano al 2007.


ISS Database



Dataset Istat
From this database it is clear that influenza mortality rates, calculated as the ratio of deaths per 100,000 population and the ISS (the latest figures for 1000 Istat) are varied to little over the years.




click to enlarge



monitoring systems rapid mortality
addition to the "rates" in the study is considered very useful to consider also the influence of excess mortality, calculated as difference between the number of deaths observed and the base value expected in the absence of influence.

A livello internazionale questo modello di analisi ha permesso anche di realizzare una efficace valutazione rapida dell'andamento della mortalità (
Fluview CDC ). Negli USA infatti per il "monitoraggio rapido" della mortalità da influenza si utilizzano due sistemi:
Reporting System – Viene valutato sul numero totale dei certificati di morte ricevuti da 122 città per gruppi di età, il numero di quelli in cui la polmonite o l’influenza vengono indicate come la causa di morte. La percentuale di tutti i decessi per polmonite e influenza (P & I) viene poi confrontata per ogni settimana con una valore soglia, calcolato utilizzando i dati di mortalità degli past five years. The observed proportion of deaths attributed to pneumonia or influenza was significantly higher than expected, when the "epidemic threshold" is exceeded.

Surveillance for Influenza-Associated Pediatric Mortality We have already commented in previous articles some of these graphs that effectively communicate the data associated pediatric mortality from pandemic influenza in progress. This monitoring system was used in the U.S. since 2004. All cases of laboratory-confirmed influenza and mortality in children are associated with reported to the surveillance system (Mortality Surveillance System).




A "quick estimate" of the trend of mortality is therefore part of the monitoring carried out in other countries, as we have seen that avoid the use of "denominations" (the number of flu cases, for example .. .'s all moot without validation). Overestimating or underestimating the "population" (denominator) which relate to the "events" will "vary" the very fact of the estimates and the reality.


analysis of historical data on the "influences" in Italy In Italy
according to some studies (ISS, University) are known historical data on excess mortality "for 32 influenza seasons studied, excess deaths were an average of 3 per 100,000 inhabitants in the years to a total of approximately 57,243 deaths caused by "pneumonia and influenza" (average 1,789 per season) "(3).




As for the possible scenarios for pandemic influenza mortality in the same study published by the CDC (3) and the relationship Istisan (4) of the same Institute of Health, have been highlighted some important data. E 'has been estimated that in Italy, in the 1918-1920 influenza has caused about 300,000 deaths, with a higher mortality than in the rest of Europe (5), in 1957-1958, excess deaths from respiratory causes seem to have been about 5,000 (6, 7), while in 1969-1970 there was an excess mortality of 20,000 deaths from pneumonia and influenza. During the pandemic of 1969-70 the excess mortality has also been:
7 times higher in the age group 0-14 years
4 times higher in people aged 15-64
2 times higher in the elderly ≥ 65
years analyzing all the data the authors (3) Check that the high rate of excess mortality in 1969 was three times higher than that of the United States and 1 times higher than in other European countries and prospects can end in Italy have to deal with increased mortality (very more pronounced between 0-64 years) in a subsequent pandemic.
Compared to the current pandemic influenza we know for months that this is recorded in the international situation prevailing mortality among young adults and children in the age group under 65 years and it is important to observe the real situation, dropping the "simple" calculations " Statistical media. "

Estimation of mortality during a pandemic To define the severity of illness and mortality during an epidemic or pandemic has been used by international institutions (8), the case fatality rate (CFR), the percentage of individuals who die every 100 confirmed cases, from Not to be confused with the mortality rate of a disease that is defined as the number of deaths per 100,000 population.

For example, if a population of 100,000 people in 20 are suffering from disease X, and a die 18 years, we have:

Mortality Rate = 18 / 100,000 = 0.00018 = 0,018%

FATALITY RATE = 18 / 20 = 0.9 = 90%






The Case fatality rate is an important epidemiological indicator combined with the attack rate (attack rate) is used to estimate the expected mortality for the current pandemic.



by NHS: Pandemic Influenza Weekly Situation Report - Planning assumptions - potential number of deaths

A common frame of reference of the overall 0.6% was calculated based on deaths registered around the world and analyzed by a team of August 2009. In the study published by Eurosurveillance (9) the CFR according to the country ranged from 0.1 to 5.1%. In Europe, the first affected country (United Kingdom), the observed rate was 0.3%, not much different from that estimated in previous studies.



When the CFR for industrialized countries fluctuates around 0.02% (20% Attack rate estimated ECDC updated 06/11/2009), but everything always depends on the quality of health care interventions and systems put in place .


Sistema di codifica della mortalità per Influenza e Polmonite
Ma in questa breve analisi vogliamo evidenziare un ulteriore elemento che deve essere preso in considerazione. Nell'aggiornamento della classificazione ICD10 sono inserite altre cause di morte, a cominciare dalla "Adult respiratory distress syndrome" (codice J80), che come abbiamo scritto rappresenta una delle complicanze più evidenti dell'influenza pandemica e motivo di ricovero nelle terapie intensive.
A guardare le stesse tavole Istat risulta chiaro che le statistiche degli anni precedenti non hanno mai "evidenziato" i dati relativi a questa causa di mortalità, ma per i decessi correlati all'influenza A/H1N1 si dovranno considerare anche questi "eventi negativi".


Conclusioni
Bisognerà dunque partire da questo tipo di dati, per definire in maniera comprensibile e misurabile "l'eccesso di mortalità" che potrà determinare l'attuale influenza pandemica. Gli scenari in corso in termini di mortalità necessitano però di essere valutati dimostrando meno "indiffirenza" e approssimazione. L' analisi dei "numeri", non deve far dimenticare che stiamo parlando di morti si misurabili ma anche evitabili, di una popolazione di bambini, giovani e adulti soprattutto under 65 con una lunga aspettativa e speranza di vita, che può essere tutelata con alcuni essenziali interventi di prevenzione... si chiama vaccination.
Rather than press releases we need to "information flow" to the occasion, also in terms of rapid surveillance "(

sr). The last round
be enough?

PS

Another round

Pippo Bruno



Bibliography and Links
Bibliography 1. Preliminary estimates of mortality by cause in the Italian regions
Year 2006. Istat
2.
The Impact of Influenza Epidemics on Mortality: Introducing a Severity Index Lone Simonsen, Matthew J. Clarke, G. David Williamson, DonnaF.Stroup, NancyH.Arden and LawrenceB.Schonberger
3.
Trends for Influenza-related Deaths During Pandemic and Epidemic Seasons, Italy, 1969-2001
Caterina Rizzo, Antonino Bella, Cécile Viboud, Lone Simonsen, Mark A. Miller, Maria Cristina Rota, Stefania Salmaso, Marta Luisa Ciofi and Acts. Istituto Superiore di Sanita, Rome, Italy, University of Bari, Italy, and National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA
4.
Scenarios of diffusion and control of an influenza pandemic in Italy

EPIC Working Group. ISSN 1123-3117 Rapporti ISTISAN 06/33
5.
Mortality peaks in Italy in the late 19th and early 20th Centuries: trends by age and sex Pinnelli A, Mancini P. - Eur J Popul 1999;14(4):333-65.
6.
Epidemiological evaluation of influenza in Italy Rocchi G, Ragona G, de Felici A, Muzzi A. - Bull World Health Organ 1974;50(5):401-6.
7.
Excess mortality from influenza in a large urban population Ragona G, Giunchi G, Rocchi G, Muzzi A, de Felici A. Rome, Italy, 1956-76. J Hyg 1978;80(2):249-57.
8.
ECDC Risk Assessment aggiornamento 6.11.09 9.
Epidemiology of fatal cases associated with pandemic H1N1 influenza 2009
Eurosurveillance, Volume 14, Issue 33, 20 August 2009
Link
WHO mortality

WHO ICD
ICD-10 on line
ACME
European Health for All
(HFA-DB)

Istat demo
Tavole di mortalità Istat
Istat indicatori socio-sanitari
Istat ICD-10
Banca dati ISS
Dataset Istat
Fluview
Istat istruzioni per la compilazione scheda di morte
(2009) Sorveglianza delle ospedalizzazioni, delle forme gravi e complicate e dei decessi... Circolare 19 novembre 2009
Circolare 26 novembre 2009
La rilevazione delle cause di morte per la sanità pubblica e per la ricerca epidemiologica- AIE

Giuseppe Bruno
  Percentage of victims in relation to the total number of people with new influences: 0,003


1. As we have always repeated in Italy the mortality of this influence is overwhelmingly lower than the rest of the world where it is around 0.4%

2. As we pointed out other times there are other data that we characterize than the rest of the world: report cases in intensive care / hospital cases, "surprisingly high"
241/489 = 0.49 In the rest around the world is at 0.10, in countries with territorial system in cui il filtro territoriale è altamente efficiente si arriva allo 0,20 (fino ad ora record assoluto: UK); Questo rapporto è l'indicatore più importante per ricavare una stima attendibile del numero di polmoniti virali che necessitano della rianimazione.

3. La stima del ministero assume un tasso di necessità del ricovero in rianimazione di 1:10.000
da noi dunque circa il 50% casi ospedalizzati (polmoniti virali) finisce in rianimazione.
Deduzioni:
a) viral pneumonia - one of two things: either a virus circulating in Italy with different characteristics from the rest of the world "very bad" or report cases to the ICU / hospitalized cases provided by the ministry is wrong.
b) The Italian mortality - one of two things: either a virus in Italy is extremely mild or estimate provided by the Ministry of the denominator is clearly wrong. See our previous post

Conclusions
In the language of the law would say "the conjunction of deductions and b" leads to an obvious contradiction of the kind of virus circulating in Italy (with respect to all the rest of the world): a virus with the most extraordinary and extraordinarily bad than good.

least we should ask the virologists account of this double feature of viral population of our country ... alternative reading: a clear "communication error" the data provided.
should note in passing that in our letter to Doctor and Child, the number of viral pneumonia that was possible estimate of 1:1000.
When the ratio of cases in intensive care / hospitalized cases in Italy was in line with international literature data obtainable Italian doctors could get a very useful data for their clinical practice. According data instead of the ministry can get more data ...
You choose which ones are reliable

Pippo Bruno
Salvo Fedele

Appendix: available places in Intensive Care
There is another small as to be this moment should be monitored: the percentage of ICU beds occupied by patients with swine flu.

resources are not unlimited: it is almost impossible for the resuscitation of a warm Italian can go beyond 10% of their availability. Apart from that roof will not be able to go con molta facilità, in particolare per rianimazioni che hanno larghi bacini di utenza e debbono gestire tante gravi emergenze in contemporanea.
Ad un certo punto il numero di soggetti in rianimazione non crescerà più, questo non significherà che il tetto di gravità della malattia sarà stato raggiunto, significherà purtroppo che non ci saranno posti per accogliere tutte le richieste. A quel punto, senza la copertura di una buona campagna vaccinale, il numero assoluto di morti crescerà improvvisamente. Tenuto conto che il numero totale dei posti di Rianimazione in Italia è di 4250 l'indice di occupazione da swine flu è facile da ricavare:
241/4250 equivale a 5,90%, in crescita di un punto rispetto al dato della scorsa settimana. L'incremento della domanda però non sarà lineare

0 comments:

Post a Comment